Das Eigenbrauer-Syndrom kann für Betroffene einen langen Leidensweg bedeuten, wie aus einem aktuellen Bericht hervorgeht. Im Zuge der Behandlung werden den Patienten nach der Diagnose antimykotische Medikamente verabreicht, und eine kohlenhydratarme Ernährung wird empfohlen. Diese Maßnahmen haben dazu geführt, dass die Symptome nach einiger Zeit dauerhaft abklingen.
Mediziner raten dazu, einen Verdacht auf das Eigenbrauer-Syndrom frühzeitig zu verfolgen, da Verzögerungen bei der Behandlung die negativen Auswirkungen auf die körperliche, soziale und finanzielle Ebene verlängern können. Bisher fehlt jedoch ein standardisiertes Diagnoseverfahren für diese Erkrankung. Bei der Therapie ist zu beachten, dass Rückfälle nach dem Absetzen der Antimykotika auftreten können, wie es bereits in vergangenen Fällen beobachtet wurde.
In Belgien wurde kürzlich ein Mann, der vermutlich am Eigenbrauer-Syndrom erkrankt war, vom Vorwurf der Trunkenheit am Steuer freigesprochen. Ein Rechtsmediziner bestätigte in diesem Fall die höchstwahrscheinliche Existenz des Syndroms. Ähnliche Freisprüche in Gerichtsverfahren gab es auch schon in den USA, was auf die Komplexität und die Herausforderungen bei der Diagnose und Behandlung dieser Erkrankung hinweist.